Objectives:
	빠르고 정확한 비 발효성 그람 음성균(Non-fermentative Gram-negative bacteria: NFGNB)의 동정은 환자 치료와 감염을 관리 하기 위해 필요하다. 그러나, 전통적인 방법으로 NFGNB의 빠르고 정확한 동정을 하기에는 그들의 낮은 생화학적 활동성으로 인해 제한된다. 본 연구는 CF와 non-CF에서 추출한 NFGNB 균종의 동정을 전통적인 방법과 MALDI-TOF MS(Biotyper) 방법을 통한 비교에 목적이 있다.
	Methods:
	본 연구에서는 105주의 NFGNB 중 CF에서 59주, non-CF에서 46주의 균주를 분리하여 사용하였다. 이 분리 균주들은 Phoenix System과 MALDI biotyper로 동정하였고 reference로 16S rRNA gene sequencing 를 이용하여 각 동정 방법과의 비교 확인을 하였다.
	Results:
	59주의 CF 분리균주 중에, MALDI Biotyper를 이용해 균종 [log(score≥2)] 및 균속 [log(score<2) and ≥1.7]으로 57주(96.6 %) 가 동정되었으며, non-CF 추출물에 대해서 40주 (89.1 %)가 균종 및 균속을 동정하였다. Phoenix는 53주 (89.8 %)의 균종/균속 동정결과를 얻었으며, non-CF에서는 40주 (89.1 %)를 동정하였다. Reference method를 통한 균종 및 균속의 동정은 93.3 % (MALDI), 89.5 % (Phoenix)정도의 신뢰도를 보였다.
	Conclusion:
	MALDI Biotyper는 NFGNB, 또는 많은 종 다양성을 가진 CF에 있어서 빠른 동정을 가능하게 하는 효율적인 방법이다. MALDI Biotyper와 Phoenix 둘 다 non-CF보다 CF에서 더 낮은 성능을 보였는데 이는 CF 에서 NFGNB종의 다양성이 더 크고, 만성감염 환자들에게서 표현형의 특징이 사라지기 때문이다. 그러나 MALDI Biotyper는 CF 분리균주 에서도 좋은 성능을 보이는 것을 확인할 수 있었다.

비 발효성 그람 음성균 (Non-fermentative Gram-negative bacteria: NFGNB)은 면역력이 저하된 환자나 낭포성 섬유증(cystic fibrosis: CF) 이 있는 환자들의 주요 병원균으로 알려져 있다. 특히 CF 환자들에게는 Burkholderia cepacia 와 같은 NFGNB의 엄격한 감염관리가 요구된다. NFGNB와 같은 병원균의 독성과 항생제 내성을 검사하기 위해서는 빠르고 정확하게 미생물의 종을 동정하는 것이 무척 중요하다. 그러나 NFGNB는 낮은 생화학적 반응도와 다양한 형태로 존재하여 이를 정확하게 동정하는 것은 쉽지 않다. 게다가, 이들의 표현형은 만성감염으로부터 표현형을 잃게 된다. PCR이나 16S rRNA gene sequencing과 같은 분자생물학적 방법으로 동정이 가능하나 이와 같은 방법은 가격이 비싸며 노동집약적 방법이라는 단점이 있다. 특히, 16S rRNA sequencing 방법은 미생물 동정의 gold standard로 사용되고 있지만, 여전히 시간이 많이 소요된다는 단점이 있다. 최근에는, matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS)를 사용하여 미생물 단백질의 spectra matching을 통한 미생물 동정이 많이 보고 되고 있다. (figure 1). 본 연구에서는 conventional method와 MALDI Biotyper를 이용한 방법으로 CF와 non-CF 환자의 NFGNB의 동정 실험을 비교하였으며 16S rRNA gene sequencing 방법으로 비교 확인하였다.

Figure 1. Evolution of bacterial identification