㈜신코에서 공급하는 Proteome software사의 Scaffold series를 소개합니다.
Scaffold series는 한눈에 단백질 시료의 데이터 해석이 가능하도록 시각적으로 디자인이 되어 있으며 단백질 시료의 비교, Post-Translational Modification(PTM), Regulated isoform등의 확인과 list up, 스펙트럼의 drill down, high through-put등의 기능뿐만 아니라 정량 및 신뢰할 수 있는 통계처리가 가능한 특징이 있습니다.
Scaffold Q+S는 Label-free 정량분석뿐만 아니라 SILAC iTRAQ, TMT등과 같은 정량분석과 그룹화 및 통계 처리를 하는 프로그램입니다.또한 다양한 시각적 접근으로 보기 쉽게 나타내어지며 user-friendly한 소프트웨어를 바탕으로 손쉽게 사용이 가능합니다.
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많은 iTRAQ, TMT and SILAC의 결과의 트랜드를 한눈에 보기 쉽게 나타내어 줍니다. |
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Up-/down- regulated protein의 강조 및 그룹화가 가능합니다. |
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Drill down기능으로 모든 샘플에 대하여 손쉽게 expression profile을 알아볼 수 있습니다. |
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Differentially-expressed protein에 따라 필터링 또는 분류가 가능합니다. |
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Input search engines |
Mascot (*.dat) |
MascotDistiller (*.rov/*.xml) |
Proteome Discoverer (*.msf) |
Spectrum Mill (Results Directory) |
SEQUEST
(*.dta/*.out, *.ms2/*.sqt, *.srf) |
Phenyx
(*.scaffold-pidres.xml) |
IdentityE/PLGS (*.xml) |
X! Tandem (*.xml) |
OMSSA
(*.omx) |
MaxQuant/Andromeda
(Results Directory) |
Scaffold PTM은 Post-Translational Modification(PTM) site와 모티프의 확인 및 여러 시료간 PTM rate의 비교,정량을 수행하는 프로그램입니다.모든 PTM에 대하여 Ascore를 바탕으로 확실한 결과를 제공합니다.
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Input search engines |
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mzIdentML formats: |
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Scaffold 3.1 또는상위버전 |
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Mascot 2.3 또는 상위버전 |
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Peaks 6.0 또는 상위버전 |
[제품 문의] Tel: 02) 2143-8262, E-mail: sc02best@scinco.com
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